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歡迎

地球上每一個活的生物:每一株細菌、每一棵橡樹、每一隻藍鯨,以及每一個人類:都使用同一本分子指令手冊。

這本指令手冊就是 DNA,是 deoxyribonucleic acid 的縮寫。

DNA 存在於你身體的幾乎每一個細胞中。它告訴你的細胞如何製造蛋白質,而蛋白質幾乎負責了維持生命的所有工作。它在你出生前就決定了你的眼睛顏色。它是貓之所以是貓,而不是仙人掌的原因。

在這堂課中,我們將一步一步地拆解 DNA。結束時,你將了解一個僅由四種化學字母組成的分子,如何編碼所有生命的指令。

暖身 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

在我們深入之前,先來回答一個問題。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

你認為貓咪身上有條紋還是斑點是由什麼決定的?請盡量猜測:這裡沒有正確或錯誤的答案。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

雙螺旋

DNA 的形狀

DNA Base Pairing

DNA 看起來像一架扭曲的梯子:科學家稱這種形狀為雙螺旋

梯子的兩條長邊稱為糖-磷酸骨架。它們由交替的糖分子(去氧核糖)與磷酸基團組成,並且將整個結構固定在一起。

梯子的橫檔是重要的部分。每個橫檔由兩個鹼基配對而成。有四種鹼基:

- A(腺嘌呤)

- T(胸腺嘧啶)

- C(胞嘧啶)

- G (鳥糞嘌呤)

Here is the critical rule: A always pairs with T, & C always pairs with G. Always. In every species. These are called base pairs, & a single base plus its sugar & phosphate is called a nucleotide.

A stretch of human DNA might read: ATCGGCTAA. If you know one side, you automatically know the other: because A pairs with T, and C pairs with G.

Who Discovered It?

The Race to Discover DNA's Structure

In 1953, James Watson & Francis Crick published the structure of DNA. They won the Nobel Prize for it in 1962.

But they could not have done it without Rosalind Franklin.

Franklin was a brilliant chemist at King's College London. She used X-ray crystallography: firing X-rays at DNA crystals and reading the patterns they made: to produce Photo 51, the clearest image of DNA's structure anyone had ever seen.

她的同事莫里斯·威爾金斯(Maurice Wilkins)在富蘭克林不知情或未經許可的情況下,將 Photo 51 展示給華生。華生後來寫道,當他看到這張照片的那一刻,雙螺旋結構就變得顯而易見了。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

富蘭克林從未獲得諾貝爾獎。她於 1958 年因卵巢癌去世,享年 37 歲:可能與她長期從事 X 射線工作有關:而諾貝爾獎不頒發給已故人士。華生和克里克當時幾乎沒有承認她的貢獻。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

今天,科學家們承認富蘭克林的實驗工作是至關重要的。她在有生之年被剝奪了應得的認可,她的故事提醒我們,科學是由人完成的:而人並不總是公平的。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

DNA 有四種鹼基:A、T、C 和 G。如果 DNA 的一條鏈讀作 ATCGGA,另一條鏈應該讀作什麼?請解釋你使用的規則。 [BLOCK_TYPE SECTION/STEP]

DNA 如何自我複製

複製密碼

DNA replication fork showing helicase, DNA polymerase, leading and lagging strands

每當細胞分裂時:無論是為了癒合傷口、讓身體成長,或是替換老舊細胞,它都必須先精確複製其所有的 DNA。這個過程稱為複製

以下是其運作方式:

1. 一種名為解旋酶的酵素會打開雙螺旋結構,透過斷裂鹼基對之間的氫鍵來進行。它實際上將雙螺旋從中間拆開。

2. 另一種稱為 DNA polymerase 的酵素會讀取每條暴露的單股鏈,並依照鹼基配對規則(A 與 T、C 與 G)建構出新的互補鏈。

3. 結果:產生兩個與原始 DNA 分子完全相同的複本。每個複本都包含一條舊鏈與一條新鏈。

你的身體大約每秒進行 3.8 million 次 這樣的複製。且幾乎每次都能正確完成:DNA polymerase 平均每複製十億個鹼基才會出錯一次。若真的發生錯誤,其他酵素通常會偵測並修復。

但並非總是如此。當錯誤未能被修正時,就會形成 mutation。我們稍後會討論為何這很重要。

為什麼 DNA 幾乎每次都能完美複製很重要?如果錯誤率高得多,會發生什麼事?

轉錄與轉譯

DNA 如何建構事物

分子生物學的中心法則

DNA 並不直接建構你的身體。它透過稱為 RNA(核糖核酸)的中介物來運作。

這個過程包含兩個主要步驟:


步驟 1:轉錄(DNA → mRNA)

DNA 的某一段(一個 基因)會被複製成一種稱為 信使 RNA(mRNA) 的分子。這就像是從一本厚厚的操作手冊中影印其中一頁。原本的 DNA 留在細胞核中保持安全;複製出來的 mRNA 則會離開細胞核,前往細胞質中進行蛋白質合成。


步驟 2:轉譯(mRNA → 蛋白質)

核糖體:細胞內負責製造蛋白質的機器,會一次讀取 mRNA 三個字母。每一組三個字母稱為一個 密碼子(codon)。每個密碼子對應一個特定的 胺基酸。胺基酸串聯起來就形成了 蛋白質


例如,密碼子 AUG 對應胺基酸甲硫胺酸(methionine),同時也代表「開始合成」的訊號。密碼子 UAA 則代表「停止」的訊號。

單一基因可能編碼出含有數百個胺基酸的蛋白質。該蛋白質可能成為消化食物的酵素、攜帶氧氣的血紅素分子,或是構成頭髮的角蛋白纖維。

一個基因 → 一條 mRNA → 一個蛋白質 → 身體中的一個功能。(這是簡化版本:現實情況更複雜:但它捕捉了核心邏輯。)

基因突變時

當基因密碼改變時會發生什麼?

突變是指 DNA 序列的任何改變。它可能是單一鹼基被替換、鹼基被刪除,或是插入額外的鹼基。

有些突變不會產生任何影響:密碼子仍會編碼相同的胺基酸(遺傳密碼中存在冗餘設計)。這類突變稱為無聲突變

有些突變會改變一個胺基酸,但蛋白質仍能正常運作。有些則會改變關鍵胺基酸,導致蛋白質功能失效。

而有些突變:極少數情況下:會產生比原始蛋白質功能更好的蛋白質。

如果基因中的單一鹼基發生突變,該基因所產生的蛋白質可能會發生什麼變化?請描述至少兩種可能的結果。

為什麼我們都不同

變異的來源

DNA 突變的類型:置換、缺失、插入及其影響

如果 DNA 複製時如此精準,為什麼我們不是完全相同的?

遺傳變異的三個主要來源:


1. 突變:隨機的複製錯誤、紫外線輻射或化學物質暴露都可能改變 DNA 中的鹼基。大多數突變是中性的。有些是有害的。少數是有益的。


2. 有性生殖:當生物進行有性生殖時,每個親代只貢獻一半的 DNA。具體的組合是隨機的。你與每位親代共享 50% 的 DNA,但你獲得的是哪 50% 則是一場基因抽獎。這就是為什麼兄弟姊妹看起來相似但不完全相同。


3. 重組:在卵細胞和精子細胞形成過程中,染色體會彼此交換片段。這種交換以父母雙方都沒有的方式重新排列基因組合。


為什麼變異很重要

遺傳變異並不是缺陷,而是生存策略。一個族群中所有個體的基因都完全相同,那麼這個族群就會很脆弱。一種疾病就可能消滅整個族群,因為沒有人具有抗性。

但在一個基因多樣化的族群中,有些個體會擁有恰好能讓它們產生抗性的突變。它們存活下來,進行繁殖,並將這種抗性傳給後代。這就是自然選擇:演化的引擎。

你能想到的每一種適應特徵:獵豹的速度、仙人掌的儲水能力、人類的大腦——都始於一場隨機突變,而這場突變恰好是有用的。

遺傳變異如何與自然選擇產生關聯?請解釋為什麼基因多樣性較高的族群,在面對新疾病時有更好的生存機會。

CRISPR與基因編輯

改寫生命的密碼

數十億年來,DNA 的變化發生得很緩慢:透過隨機突變和自然選擇。

這一切在 2012 年改變了。

Jennifer Doudna 和 Emmanuelle Charpentier 發現,一種稱為 CRISPR-Cas9 的細菌防禦系統可以被重新編程,用來在任何精確位置切割 DNA。她們因此獲得 2020 年諾貝爾化學獎。

CRISPR 就像帶有 GPS 的分子剪刀。你給它一段與目標 DNA 序列相匹配的 guide RNA,Cas9 蛋白質就會在精確的位置切割 DNA。接著,細胞自身的修復機制會修復這個切割:你可以在修復過程中插入修正後的基因。

這是一項革命性的技術。科學家已經使用 CRISPR 來:

- 透過編輯患者的造血幹細胞,在臨床試驗中治癒鐮狀細胞貧血症

- 無需傳統育種即可創造抗病作物

- 開發肌肉萎縮症、某些癌症及 HIV 的潛在治療方法


但 CRISPR 也引發了巨大的倫理問題。

2018 年,一位名叫賀建奎的中國科學家宣布,他已使用 CRISPR 技術編輯了人類胚胎的 DNA:雙胞胎女嬰因此誕生,並帶有經過修飾的基因。全球科學界譴責此舉魯莽且不成熟。賀建奎被判處三年有期徒刑。

核心困境在於:編輯胚胎的 DNA 會改變個體體內的每一個細胞,而這些改變會遺傳給他們的孩子,以及孩子的孩子。我們正在談論永久改變人類基因庫。

基因檢測 本身也引發了許多問題。如今,你可以吐一口唾液到試管中,就能得知自己罹患數百種疾病的風險。但雇主或保險公司是否應有權取得這些資訊?父母是否應能根據智力或運動能力等特質選擇胚胎?

我們應該編輯人類 DNA 嗎?

輪到你來論證

這些問題沒有單一的正確答案。但有論證充分的答案,也有論證不足的答案。

強而有力的論點會同時考量潛在的益處與風險,使用證據,並承認議題的複雜性。

我們應該編輯人類DNA嗎?請考慮治癒遺傳疾病與增強身高或智力等特質的案例。以至少兩個理由為你的立場辯護。

你會記住什麼?

最後的想法

你以一個關於貓的問題開始這堂課。

現在你知道答案存在於一條由四種化學字母組成的扭曲梯子中:這段代碼如此優雅,以至於它驅動著地球上每一種生物,而它又如此強大,以至於我們才剛開始學習如何改寫它。

DNA 科學的發展速度超過了人類歷史上的任何時期。正在學習這些材料的學生,將會是那些決定如何使用它的人。

用一兩句話描述,你在這堂課中學到最重要或最令人驚訝的事是什麼?它如何改變了你對生物的看法?